APOBEC3B

APOBEC3B
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	5CQD, 5CQH, 5CQI, 5CQK, 2NBQ
معرفات
أسماء بديلة	APOBEC3B, A3B, APOBEC1L, ARCD3, ARP4, DJ742C19.2, PHRBNL, bK150C2.2, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 607110 MGI: MGI:1933111 HomoloGene: 105420 GeneCards: 9582
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines; • ربط أيون الزنك; • نشاط تحفيزي; • نشاط هيدرولاز; • ربط أيون فلزي; • deoxycytidine deaminase activity; • RNA binding; • cytidine deaminase activity;
مكونات خلوية	• نواة; • سيتوبلازم;
عمليات حيوية	• negative regulation of transposition; • مناعة فطرية; • immune system process; • defense response to virus; • cytidine deamination; • cytidine to uridine editing; • DNA demethylation;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
	Q9UH17
	Q99J72
	‏NM_001270411 NM_004900، ‏NM_001270411
	‏NM_030255، ‏XM_006521553، ‏XM_017316806، ‏XM_017316808، ‏XR_001781583، ‏NM_001347041، ‏XM_036159640 NM_001160415، ‏NM_030255، ‏XM_006521553، ‏XM_017316806، ‏XM_017316808، ‏XR_001781583، ‏NM_001347041، ‏XM_036159640
	‏NP_004891 NP_001257340، ‏NP_004891
	‏NP_001333970، ‏NP_084531، ‏XP_006521616، ‏XP_017172295، ‏XP_017172297، ‏XP_036015533 NP_001153887، ‏NP_001333970، ‏NP_084531، ‏XP_006521616، ‏XP_017172295، ‏XP_017172297، ‏XP_036015533
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

APOBEC3B‏ (Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين APOBEC3B في الإنسان.^[1]^[2]^[3]

الوظيفة

الأهمية السريرية

المراجع

^ "Entrez Gene: APOBEC3B apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3B". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
^ Madsen P، Anant S، Rasmussen HH، Gromov P، Vorum H، Dumanski JP، Tommerup N، Collins JE، Wright CL، Dunham I، MacGinnitie AJ، Davidson NO، Celis JE (سبتمبر 1999). "Psoriasis upregulated phorbolin-1 shares structural but not functional similarity to the mRNA-editing protein apobec-1". J Invest Dermatol. ج. 113 ع. 2: 162–9. DOI:10.1046/j.1523-1747.1999.00682.x. PMID:10469298.
^ Jarmuz A، Chester A، Bayliss J، Gisbourne J، Dunham I، Scott J، Navaratnam N (فبراير 2002). "An anthropoid-specific locus of orphan C to U RNA-editing enzymes on chromosome 22". Genomics. ج. 79 ع. 3: 285–96. DOI:10.1006/geno.2002.6718. PMID:11863358.

قراءة متعمقة

Wedekind JE، Dance GS، Sowden MP، Smith HC (2003). "Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business". Trends Genet. ج. 19 ع. 4: 207–16. DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4. PMID:12683974.
Dunham I؛ Shimizu N؛ Roe BA؛ وآخرون (1999). "The DNA sequence of human chromosome 22". Nature. ج. 402 ع. 6761: 489–95. DOI:10.1038/990031. PMID:10591208. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
Strausberg RL؛ Feingold EA؛ Grouse LH؛ وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
Mariani R؛ Chen D؛ Schröfelbauer B؛ وآخرون (2003). "Species-specific exclusion of APOBEC3G from HIV-1 virions by Vif". Cell. ج. 114 ع. 1: 21–31. DOI:10.1016/S0092-8674(03)00515-4. PMID:12859895. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
Sawyer SL، Emerman M، Malik HS (2006). "Ancient Adaptive Evolution of the Primate Antiviral DNA-Editing Enzyme APOBEC3G". PLoS Biol. ج. 2 ع. 9: E275. DOI:10.1371/journal.pbio.0020275. PMC:479043. PMID:15269786.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Yu Q؛ Chen D؛ König R؛ وآخرون (2005). "APOBEC3B and APOBEC3C are potent inhibitors of simian immunodeficiency virus replication". J. Biol. Chem. ج. 279 ع. 51: 53379–86. DOI:10.1074/jbc.M408802200. PMID:15466872. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Gerhard DS؛ Wagner L؛ Feingold EA؛ وآخرون (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
Rose KM، Marin M، Kozak SL، Kabat D (2005). "Regulated production and anti-HIV type 1 activities of cytidine deaminases APOBEC3B, 3F, and 3G". AIDS Res. Hum. Retroviruses. ج. 21 ع. 7: 611–9. DOI:10.1089/aid.2005.21.611. PMID:16060832.
Bogerd HP؛ Wiegand HL؛ Doehle BP؛ وآخرون (2006). "APOBEC3A and APOBEC3B are potent inhibitors of LTR-retrotransposon function in human cells". Nucleic Acids Res. ج. 34 ع. 1: 89–95. DOI:10.1093/nar/gkj416. PMC:1326241. PMID:16407327. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
Stenglein MD، Harris RS (2006). "APOBEC3B and APOBEC3F inhibit L1 retrotransposition by a DNA deamination-independent mechanism". J. Biol. Chem. ج. 281 ع. 25: 16837–41. DOI:10.1074/jbc.M602367200. PMID:16648136.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Hakata Y، Landau NR (2007). "Reversed functional organization of mouse and human APOBEC3 cytidine deaminase domains". J. Biol. Chem. ج. 281 ع. 48: 36624–31. DOI:10.1074/jbc.M604980200. PMID:17020885.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Kidd JM؛ Newman TL؛ Tuzun E؛ وآخرون (2007). "Population Stratification of a Common APOBEC Gene Deletion Polymorphism". PLoS Genet. ج. 3 ع. 4: e63. DOI:10.1371/journal.pgen.0030063. PMC:1853121. PMID:17447845. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)

An APOBEC cytidine deaminase mutagenesis pattern is widespread in human cancers

Steven A Roberts, Michael S Lawrence, Leszek J Klimczak, Sara A Grimm, David Fargo, Petar Stojanov, Adam Kiezun, Gregory V Kryukov, Scott L Carter, Gordon Saksena, Shawn Harris, Ruchir R Shah, Michael A Resnick, Gad Getz & Dmitry A Gordenin

Candace D Middlebrooks, A Rouf Banday, Konichi Matsuda, et al. Association of germline variants in the APOBEC3 region with cancer risk and enrichment with APOBEC-signature mutations in tumors Exit Disclaimer. Nature Genetics 2016.

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

[1] "Entrez Gene: APOBEC3B apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3B". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

[2] Madsen P، Anant S، Rasmussen HH، Gromov P، Vorum H، Dumanski JP، Tommerup N، Collins JE، Wright CL، Dunham I، MacGinnitie AJ، Davidson NO، Celis JE (سبتمبر 1999). "Psoriasis upregulated phorbolin-1 shares structural but not functional similarity to the mRNA-editing protein apobec-1". J Invest Dermatol. ج. 113 ع. 2: 162–9. DOI:10.1046/j.1523-1747.1999.00682.x. PMID:10469298.

[3] Jarmuz A، Chester A، Bayliss J، Gisbourne J، Dunham I، Scott J، Navaratnam N (فبراير 2002). "An anthropoid-specific locus of orphan C to U RNA-editing enzymes on chromosome 22". Genomics. ج. 79 ع. 3: 285–96. DOI:10.1006/geno.2002.6718. PMID:11863358.

[1]

[2]

[3]