رنا صغير بكتيري
الرنا الصغير البكتيري (بالإنجليزية: Bacterial small RNA) هو رنا غير مشفر صغير طوله حوالي 50-100 نوكليوتيد تُنتجه البكتيريا وهو ذو بنية منتظمة للغاية ويحتوي على العديد من الحلقات الجذعية.[1][2] تم تحديد الكثير من جزيئات الرنا الصغيرة باستخدام تقنيات تحليل حاسوبية وتقنيات مخبرية مثل: لطخة نورثرن، المصفوفات الدقيقة، سَلسَلة الرنا [3] في العديد من أجناس البكتيريا بما في ذلك الإشريكية القولونية،[4][5][6] النموذج الممرض من السلمونيلا،[7] بكتيريا سينوريزوبيوم ميليلوتي من عائلة متقلبات ألفا المثبتة للنيتروجين،[8] البكتيريا الزرقاء البحرية،[9] الفرنسيسيلة التولارية (العامل المسبب لداء توليري)،[10]العقدية المقيحة،[11] المكورة العنقودية الذهبية الممرضة،[12] وممرضة النبات المستصفرة الرزية.[13]
يؤثر الرنا البكتيري الصغير على كيفية التعبير عن الجينات داخل الخلايا البكتيرية عبر التآثر مع الرنا الرسول أو البروتين، وبذلك يؤثر على مجموعة متنوعة من الوظائف البكتيرية كالأيض، حدة الجرثوم، الاستجابة للإجهاد البيئي والبنية.[7][12]
مراجع
عدل- ^ Vogel J، Wagner EG (يونيو 2007). "Target identification of small noncoding RNAs in bacteria". Curr. Opin. Microbiol. ج. 10 ع. 3: 262–70. DOI:10.1016/j.mib.2007.06.001. PMID:17574901.
- ^ Viegas SC، Arraiano CM (2008). "Regulating the regulators: How ribonucleases dictate the rules in the control of small non-coding RNAs". RNA Biol. ج. 5 ع. 4: 230–43. DOI:10.4161/rna.6915. PMID:18981732.
- ^ Wassarman KM، Repoila F، Rosenow C، Storz G، Gottesman S (يوليو 2001). "Identification of novel small RNAs using comparative genomics and microarrays". Genes Dev. ج. 15 ع. 13: 1637–51. DOI:10.1101/gad.901001. PMC:312727. PMID:11445539.
- ^ Hershberg R، Altuvia S، Margalit H (أبريل 2003). "A survey of small RNA-encoding genes in Escherichia coli". Nucleic Acids Res. ج. 31 ع. 7: 1813–20. DOI:10.1093/nar/gkg297. PMC:152812. PMID:12654996.
- ^ Rivas E، Klein RJ، Jones TA، Eddy SR (سبتمبر 2001). "Computational identification of noncoding RNAs in E. coli by comparative genomics". Curr. Biol. ج. 11 ع. 17: 1369–73. DOI:10.1016/S0960-9822(01)00401-8. PMID:11553332.
- ^ Argaman L، Hershberg R، Vogel J، وآخرون (يونيو 2001). "Novel small RNA-encoding genes in the intergenic regions of Escherichia coli". Curr. Biol. ج. 11 ع. 12: 941–50. DOI:10.1016/S0960-9822(01)00270-6. PMID:11448770.
- ^ ا ب Vogel J (يناير 2009). "A rough guide to the non-coding RNA world of Salmonella". Mol. Microbiol. ج. 71 ع. 1: 1–11. DOI:10.1111/j.1365-2958.2008.06505.x. PMID:19007416.
- ^ Schlüter JP، Reinkensmeier J، Daschkey S، وآخرون (2010). "A genome-wide survey of sRNAs in the symbiotic nitrogen-fixing alpha-proteobacterium Sinorhizobium meliloti". BMC Genomics. ج. 11: 245. DOI:10.1186/1471-2164-11-245. PMC:2873474. PMID:20398411.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link) - ^ Axmann IM، Kensche P، Vogel J، Kohl S، Herzel H، Hess WR (2005). "Identification of cyanobacterial non-coding RNAs by comparative genome analysis". Genome Biol. ج. 6 ع. 9: R73. DOI:10.1186/gb-2005-6-9-r73. PMC:1242208. PMID:16168080.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link) - ^ Postic G، Frapy E، Dupuis M، وآخرون (2010). "Identification of small RNAs in Francisella tularensis". BMC Genomics. ج. 11: 625. DOI:10.1186/1471-2164-11-625. PMC:3091763. PMID:21067590.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link) - ^ Tesorero، Rafael A.؛ Yu، Ning؛ Wright، Jordan O.؛ Svencionis، Juan P.؛ Cheng، Qiang؛ Kim، Jeong-Ho؛ Cho، Kyu Hong (1 يناير 2013). "Novel regulatory small RNAs in Streptococcus pyogenes". PLOS One. ج. 8 ع. 6: e64021. DOI:10.1371/journal.pone.0064021. ISSN:1932-6203. PMC:3675131. PMID:23762235.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link) - ^ ا ب Felden، Brice؛ Vandenesch، François؛ Bouloc، Philippe؛ Romby، Pascale (10 مارس 2011). "The Staphylococcus aureus RNome and Its Commitment to Virulence". PLoS Pathogens. ج. 7 ع. 3. DOI:10.1371/journal.ppat.1002006. ISSN:1553-7366. PMC:3053349. PMID:21423670.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link) - ^ Liang H، Zhao YT، Zhang JQ، Wang XJ، Fang RX، Jia YT (2011). "Identification and functional characterization of small non-coding RNAs in Xanthomonas oryzae pathovar oryzae". BMC Genomics. ج. 12: 87. DOI:10.1186/1471-2164-12-87. PMC:3039613. PMID:21276262.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)