رنا ريبوسومي S5

الرنا الريبوسومي S5 (بالإنجليزية: ARN ribosomique 5S)‏ هو أحد جزيئات الرنا الريبوسومي الصغيرة ويتكون من 121 نوكليوتيد ^[2] ووزنه 40 كدا، وهو مكون هيكلي ووظيفي للوحدة الفرعية الكبيرة للريبوسوم في جميع نطاقات الحياة (بكتيريا، عتائق وحقيقيات النوى) باستثناء رنا المتقدرة لدى الفطريات والحيوانات.^[3] تشير العلامة S5 إلى سرعة التثفل (الترسب) أثناء الطرد المركزي الفائق، والتي تقاس بوحدة سفيدبرغ.^[4]

التخليق الحيوي

لدى حقيقيات النوى، يتواجد الرنا 5S عادة في مشغلات الرنا الريبوسومي مع الاتجاه من الرنا الريبوسومي الخاص بالوحدة الفرعية الكبيرة والصغيرة، ويترجمون معا إلى نسخة أولية عديدة السيسترون.^[5] ميزة خاصة بجينوم حقيقيات النوى هي تواجدُ عدة جينات مشفِّرة للرنا 5S ‏ (5S rDNA) متجمعة في تكرارات ترادفية، مع كون عددها يختلف من جنس لآخر.^[6]^[7] يُخلَّق الرنا 5S الخاص بحقيقيات النوى بواسطة بوليميراز الرنا 3 في حين أن بقية جزيئات الرنا الريبوسومي الأخرى تُقص من الرنا الأولي 45S المنسوخ بواسطة بوايميراز الرنا 1. في الخلية البيضية للقيطم، تبين أن الأصابع 4-7 من أصابع الزنك التسعة الخاصة بعامل النسخ TFIIIA يمكنها الارتباط بالموقع المركزي للرنا 5S.^[8]^[9] الارتباط بين الرنا 5S وTFIIIA له وظيفتان: الأولى كبت ترجمة المزيد من جين الرنا 5S والثانية ضمان استقرار نسخة الرنا حتى تكون هنالك حاجة إليها عند تجميع الريبوسوم.^[10]

البنية

تتكون البنية الثانوية للرنا 5S من خمسة لوالب (يرمز إليها من V-I بالأرقام الرومانية)، أربع حلقات (E-B) ومفصل واحد وتشكل جميع هذه الأنماط البنيوية بنية تشبه حرف Y. الحلقتان C وD هما حلقتان جذعيتان نهائيتان، والحلقتان B وE داخليتان.^[6] تبعا لدراسات علم تطور السلالات من الأرجح أن اللولبين I وIII سلفيان (موروث من سلف مشترك).^[11] يشمل اللولب III جزيئتي أدينوسين عاليتا الانحفاظ.^[12] يُعتقد أن اللولب V -وهو بنية حلقة جذعية- يتآثر مع عامل النسخ TFIIIA.^[6]

مراجع

^ Mueller F، Sommer I، Baranov P، Matadeen R، Stoldt M، Wöhnert J، Görlach M، van Heel M، Brimacombe R (2000). "The 3D arrangement of the 23 S and 5 S rRNA in the Escherichia coli 50 S ribosomal subunit based on a cryo-electron microscopic reconstruction at 7.5 A resolution". J Mol Biol. ج. 298 ع. 1: 35–59. DOI:10.1006/jmbi.2000.3635. PMID:10756104.
^ (بالإنجليزية) Homo sapiens RNA, 5S ribosomal 17 (RNA5S17), ribosomal RNA, sur le site du NCBI. نسخة محفوظة 2 فبراير 2018 على موقع واي باك مشين.
^ (بالإنجليزية) Maciej Szymanski, Miroslawa Z. Barciszewska, Volker A. Erdmann et Jan Barciszewski, « 5S Ribosomal RNA Database », في Nucleic Acid Research, vol. 30, n^o 1, janvier 2002, ص. 176-178 [النص الكامل, lien PMID, lien DOI (pages consultées le 22 août 2014)] "نسخة مؤرشفة". مؤرشف من الأصل في 2021-03-22. اطلع عليه بتاريخ 2021-03-23.{{استشهاد ويب}}: صيانة الاستشهاد: BOT: original URL status unknown (link)
^ Szymanski M، Barciszewska MZ، Erdmann VA، Barciszewski J (يناير 2002). "5S Ribosomal RNA Database". Nucleic Acids Res. ج. 30 ع. 1: 176–8. DOI:10.1093/nar/30.1.176. PMC:99124. PMID:11752286.
^ Kaczanowska، M؛ Rydén-Aulin، M (سبتمبر 2007). "Ribosome biogenesis and the translation process in Escherichia coli". Microbiology and Molecular Biology Reviews. ج. 71 ع. 3: 477–494. DOI:10.1128/MMBR.00013-07. PMC:2168646. PMID:17804668.
^ ^ا ^ب ^ج Ciganda، Martin؛ Williams, Noreen (يوليو 2011). "Eukaryotic 5S rRNA biogenesis". Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA. ج. 2 ع. 4: 523–533. DOI:10.1002/wrna.74. PMC:3278907. PMID:21957041.
^ Douet، J؛ Tourmente, S (يوليو 2007). "Transcription of the 5S rRNA heterochromatic genes is epigenetically controlled in Arabidopsis thaliana and Xenopus laevis". Heredity. ج. 99 ع. 1: 5–13. DOI:10.1038/sj.hdy.6800964. PMID:17487217.
^ McBryant، SJ؛ Veldhoen, N؛ Gedulin, B؛ Leresche, A؛ Foster, MP؛ Wright, PE؛ Romaniuk, PJ؛ Gottesfeld, JM (1995). "Interaction of the RNA binding fingers of Xenopus transcription factor IIIA with specific regions of 5 S ribosomal RNA". Journal of Molecular Biology. ج. 248 ع. 1: 44–57. DOI:10.1006/jmbi.1995.0201. PMID:7731045.
^ Searles، MA؛ Lu D؛ Klug A (2000). "The role of the central zinc fingers of transcription factor IIIA in binding to 5 S RNA". J Mol Biol. ج. 301 ع. 1: 47–60. DOI:10.1006/jmbi.2000.3946. PMID:10926492.
^ Pelham، HRB؛ Brown DD (1980). "A specific transcription factor that can bind either the 5S RNA gene or 5S RNA". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. ج. 77 ع. 7: 4170–4174. DOI:10.1073/pnas.77.7.4170. PMC:349792. PMID:7001457.
^ Sun، FJ؛ Caetano-Anollés, G (نوفمبر 2009). "The evolutionary history of the structure of 5S ribosomal RNA". Journal of Molecular Evolution. ج. 69 ع. 5: 430–43. DOI:10.1007/s00239-009-9264-z. PMID:19639237.
^ DiNitto، JP؛ Huber, PW (23 أكتوبر 2001). "A role for aromatic amino acids in the binding of Xenopus ribosomal protein L5 to 5S rRNA". Biochemistry. ج. 40 ع. 42: 12645–53. DOI:10.1021/bi011439m. PMID:11601989.

[pmid10756104-1] Mueller F، Sommer I، Baranov P، Matadeen R، Stoldt M، Wöhnert J، Görlach M، van Heel M، Brimacombe R (2000). "The 3D arrangement of the 23 S and 5 S rRNA in the Escherichia coli 50 S ribosomal subunit based on a cryo-electron microscopic reconstruction at 7.5 A resolution". J Mol Biol. ج. 298 ع. 1: 35–59. DOI:10.1006/jmbi.2000.3635. PMID:10756104.

[2] (بالإنجليزية) Homo sapiens RNA, 5S ribosomal 17 (RNA5S17), ribosomal RNA, sur le site du NCBI. نسخة محفوظة 2 فبراير 2018 على موقع واي باك مشين.

[10.1093/nar/30.1.176-3] (بالإنجليزية) Maciej Szymanski, Miroslawa Z. Barciszewska, Volker A. Erdmann et Jan Barciszewski, « 5S Ribosomal RNA Database », في Nucleic Acid Research, vol. 30, n^o 1, janvier 2002, ص. 176-178 [النص الكامل, lien PMID, lien DOI (pages consultées le 22 août 2014)] "نسخة مؤرشفة". مؤرشف من الأصل في 2021-03-22. اطلع عليه بتاريخ 2021-03-23.{{استشهاد ويب}}: صيانة الاستشهاد: BOT: original URL status unknown (link)

[pmid11752286-4] Szymanski M، Barciszewska MZ، Erdmann VA، Barciszewski J (يناير 2002). "5S Ribosomal RNA Database". Nucleic Acids Res. ج. 30 ع. 1: 176–8. DOI:10.1093/nar/30.1.176. PMC:99124. PMID:11752286.

[Kaczanowska-5] Kaczanowska، M؛ Rydén-Aulin، M (سبتمبر 2007). "Ribosome biogenesis and the translation process in Escherichia coli". Microbiology and Molecular Biology Reviews. ج. 71 ع. 3: 477–494. DOI:10.1128/MMBR.00013-07. PMC:2168646. PMID:17804668.

[Ciganda_523–533-6] ا ^ب ^ج Ciganda، Martin؛ Williams, Noreen (يوليو 2011). "Eukaryotic 5S rRNA biogenesis". Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA. ج. 2 ع. 4: 523–533. DOI:10.1002/wrna.74. PMC:3278907. PMID:21957041.

[7] Douet، J؛ Tourmente, S (يوليو 2007). "Transcription of the 5S rRNA heterochromatic genes is epigenetically controlled in Arabidopsis thaliana and Xenopus laevis". Heredity. ج. 99 ع. 1: 5–13. DOI:10.1038/sj.hdy.6800964. PMID:17487217.

[McBryant_1995-8] McBryant، SJ؛ Veldhoen, N؛ Gedulin, B؛ Leresche, A؛ Foster, MP؛ Wright, PE؛ Romaniuk, PJ؛ Gottesfeld, JM (1995). "Interaction of the RNA binding fingers of Xenopus transcription factor IIIA with specific regions of 5 S ribosomal RNA". Journal of Molecular Biology. ج. 248 ع. 1: 44–57. DOI:10.1006/jmbi.1995.0201. PMID:7731045.

[Searles_2000-9] Searles، MA؛ Lu D؛ Klug A (2000). "The role of the central zinc fingers of transcription factor IIIA in binding to 5 S RNA". J Mol Biol. ج. 301 ع. 1: 47–60. DOI:10.1006/jmbi.2000.3946. PMID:10926492.

[Pelham_1980-10] Pelham، HRB؛ Brown DD (1980). "A specific transcription factor that can bind either the 5S RNA gene or 5S RNA". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. ج. 77 ع. 7: 4170–4174. DOI:10.1073/pnas.77.7.4170. PMC:349792. PMID:7001457.

[11] Sun، FJ؛ Caetano-Anollés, G (نوفمبر 2009). "The evolutionary history of the structure of 5S ribosomal RNA". Journal of Molecular Evolution. ج. 69 ع. 5: 430–43. DOI:10.1007/s00239-009-9264-z. PMID:19639237.

[12] DiNitto، JP؛ Huber, PW (23 أكتوبر 2001). "A role for aromatic amino acids in the binding of Xenopus ribosomal protein L5 to 5S rRNA". Biochemistry. ج. 40 ع. 42: 12645–53. DOI:10.1021/bi011439m. PMID:11601989.

[2]

[3]

[4]

[1]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]